Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc11P31313 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms