Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa2P31245 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxa2P31245 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms