Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GrnP28798 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GrnP28798 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GrnP28798 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GrnP28798 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GrnP28798 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GrnP28798 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GrnP28798 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GrnP28798 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GrnP28798 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GrnP28798 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms