Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apex1P28352 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apex1P28352 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apex1P28352 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms