Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa5P28312 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa5P28312 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa5P28312 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms