Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja8P28236 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja8P28236 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms