Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde6aP27664 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms