Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Twist1P26687 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Twist1P26687 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Twist1P26687 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms