Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CftrP26361 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CftrP26361 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CftrP26361 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CftrP26361 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CftrP26361 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CftrP26361 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CftrP26361 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CftrP26361 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CftrP26361 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CftrP26361 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CftrP26361 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CftrP26361 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CftrP26361 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CftrP26361 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CftrP26361 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CftrP26361 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CftrP26361 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CftrP26361 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CftrP26361 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CftrP26361 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CftrP26361 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CftrP26361 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CftrP26361 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CftrP26361 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CftrP26361 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CftrP26361 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CftrP26361 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CftrP26361 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CftrP26361 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CftrP26361 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CftrP26361 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CftrP26361 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CftrP26361 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CftrP26361 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CftrP26361 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CftrP26361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CftrP26361 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CftrP26361 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CftrP26361 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CftrP26361 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms