Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna1P26231 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnna1P26231 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms