Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gria1P23818 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gria1P23818 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gria1P23818 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.6 ms