Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd11P23813 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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