Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms