Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ggta1P23336 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ggta1P23336 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ggta1P23336 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ggta1P23336 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms