Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3aP23116 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3aP23116 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3aP23116 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms