Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp36P22893 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms