Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tap1P21958 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tap1P21958 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tap1P21958 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms