Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f1P21952 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms