Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnc2P20801 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnc2P20801 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms