Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prim1P20664 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prim1P20664 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim1P20664 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim1P20664 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim1P20664 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms