Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms