Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lsp1P19973 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lsp1P19973 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lsp1P19973 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms