Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms