Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnnc1P19123 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms