Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps6ka1P18653 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms