Protein–RNA interactions for Protein: P16872

Il7r, Interleukin-7 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il7rP16872 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Il7rP16872 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Il7rP16872 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Il7rP16872 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Il7rP16872 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Il7rP16872 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms