Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ass1P16460 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ass1P16460 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms