Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PolP11369 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PolP11369 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PolP11369 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PolP11369 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PolP11369 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PolP11369 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PolP11369 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PolP11369 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PolP11369 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PolP11369 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PolP11369 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PolP11369 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PolP11369 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PolP11369 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PolP11369 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms