Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sub1P11031 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms