Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spp1P10923 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spp1P10923 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spp1P10923 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms