Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl2P10889 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms