Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd4P10628 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms