Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd8bP10300 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms