Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb4P10284 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb4P10284 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb4P10284 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms