Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl2P10148 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms