Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl1P10146 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms