Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Schip1P0DPB4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Schip1P0DPB4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Schip1P0DPB4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms