Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly6c1P0CW02 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms