Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbk3P0C5K0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sbk3P0C5K0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms