Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb2P0C1T1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb2P0C1T1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms