Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3P09027 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms