Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06336 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06336 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06336 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06336 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06336 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P06336 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06336 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06336 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06336 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P06336 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06336 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06336 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06336 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P06336 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P06336 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06336 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms