Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa7P02830 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa7P02830 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms