Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Col4a1P02463 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a1P02463 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms