Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms