Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01822 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01822 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01822 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01822 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01822 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01822 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01822 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01822 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01822 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01822 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01822 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01822 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01822 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01822 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms