Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01792 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01792 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01792 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01792 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01792 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01792 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01792 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01792 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01792 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01792 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01792 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01792 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms