Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01757 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01757 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01757 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01757 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01757 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01757 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01757 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01757 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01757 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01757 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01757 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01757 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms