Protein–RNA interactions for Protein: P01754

Ighv1-62-3, Ig heavy chain V region 1-62-3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-62-3P01754 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-62-3P01754 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-62-3P01754 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-62-3P01754 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv1-62-3P01754 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms