Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01748 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01748 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01748 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01748 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01748 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01748 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01748 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01748 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01748 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01748 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01748 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01748 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01748 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01748 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01748 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01748 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms